Но прежде чем перейти к описанию программы, а точнее игры, FoldIt, вернемся к методам определения структуры белка



страница8/8
Дата02.06.2018
Размер2,77 Mb.
1   2   3   4   5   6   7   8
Рис.8. Второй способ укладки. Количество очков – 9255.



Рис.9. Третий способ укладки. Количество очков – 9363.

Выводы

  1. FoldIt является относительно точным, удобным и перспективным методом получения и уточнения пространственной структуры белка.

  2. Для решения важной, но трудоемкой задачи по укладке белка теперь могут привлекаться люди, не имеющие отношения к науке (просто играя и приятно проводя время).

  3. Программа FoldIt имеет множество встроенных инструментов и рецептов, которые не очень сложны в использовании и весьма упрощают процесс укладки белка.

  4. По сравнению с полностью автоматизированными программами FoldIt справляется с некоторыми задачами гораздо лучше. Однако нельзя полностью полагаться на интуицию человека, поскольку, начиная сборку белка с самого начала, игроку тяжело точно определить, как лучше всего свернуть белок. Требуется сочетание автоматизированного процесса и человеческих усилий.

  5. FoldIt - прекрасный способ действительно помочь в решении какой-либо задачи, почувствовать свою причастность к великому открытию и возможность завести новые и полезные знакомства, поскольку в FoldIt встроена функция чата.


Список литературы

  1. Gilski M, Kazmierczyk M, Krzywda S, Zábranská H, Cooper S, Popović Z, Khatib F, DiMaio F, Thompson J, Baker D, Pichová I, Jaskolski M.(2011); High-resolution structure of a retroviral protease folded as a monomer. Acta Crystallogr. D. Biol. Crystallogr. 67(Pt 11):907-14

  2. Good BM, Su AI. (2011); Games with a scientific purpose; Genome Biology; 12:135

  3. Cooper S, Khatib F, Treuille A, Barbero J, Lee J, Beenen M, Leaver-Fay A, Baker D, Popović Z, Players F. (2010); Predicting protein structures with a multiplayer online game. Nature; 466(7307):756-60.

  4. Khatib F, DiMaio F; Foldit Contenders Group; Foldit Void Crushers Group, Cooper S, Kazmierczyk M, Gilski M, Krzywda S, Zabranska H, Pichova I, Thompson J, Popović Z, Jaskolski M, Baker D. (2011); Crystal structure of a monomeric retroviral protease solved by protein folding game players.; Nat Struct Mol Biol, 8(10):1175-7. doi: 10.1038/nsmb.2119

  5. Khatib F, Cooper S, Tyka MD, Xu K, Makedon I, Popovic Z, Baker D, Players F. (2011); Algorithm discovery by protein folding game players.; Proc Natl Acad Sci U S A. 108(47):18949-53

  6. http://ru.wikiversity.org/wiki/FoldIt_Wiki

  7. http://www.the-scientist.com/?articles.view/articleNo/31155/title/Public-Solves-Protein-Structure/

  8. http://www.sciencedaily.com/releases/2001/02/010214074736.htm

  9. Editorial: So much more to know. Science 2005, 309:78-102

  10. Dill, Ken A. et al. The protein folding problem: when will it be solved? Current Opinion in Structural Biology 2007, 17:342–346.

  11. Rigden, Daniel J. From Protein Structure to Function with Bioinformatics. Springer Science. 2009. ISBN: 978-1-4020-9057-8.

  12. http://www.compbio.dundee.ac.uk/www-jpred/results/jp_reXEEMo/jp_reXEEMo.html


Поделитесь с Вашими друзьями:
1   2   3   4   5   6   7   8


База данных защищена авторским правом ©grazit.ru 2017
обратиться к администрации

    Главная страница